تم إطلاق هذا البرنامج عام  2011وذلك  مساهمة في تحقيق رؤية جامعة بوليتكنيك فلسطين التي تتمثل في (جامعة علوم وتكنولوجيا وإبداع عالمية). وتعمل كلية الهندسة باستمرار على طرح وتطوير البرامج الهندسية التي تستجيب للاحتياجات المحلية وتتوافق مع المعايير العلمية والعالمية. ويأتي برنامج هندسة تكنولوجيا البيئة كخطوة على هذا الطريق التصاعدي لتسهم في توفير الكوادر البشرية والخبرات العلمية والحلول التقنية ذات العلاقة بواقع البيئة المحلي والعالمي.

وتتمثل رسالة هذا البرنامج في العمل على توفير كوادر هندسية قادرة على أداء الدور التكنولوجي في مواجهة المشاكل البيئية الناجمة عن النشاط الصناعي والزراعي والعمراني والخدماتي والصحي, وتلك التي تنتج عن استنزاف الموارد الطبيعية وزيادة التلوث البيئي مما يتطلب إدارة مستدامة لجميع هذه المصادر.

ويختص هذا البرنامج بدراسة الوسائل والتقنيات الضرورية للمحافظة على البيئة وضمان توفر العناصر الضرورية للحياة كالماء والهواء بمستوى معين من الجودة للحفاظ على صحة الإنسان وبيئته. ومن أمثلة ذلك تصميم وتنفيذ شبكات توزيع المياه وشبكات تجميع مياه الصرف والأمطار ومحطات معالجة المياه ومحطات معالجة مياه الصرف الصحي لإعادة استخدامها في المجال الصناعي والزراعي, وأيضا دراسة التقنيات المختلفة للحد من ملوثات الهواء والماء وطرق التخلص السليم من النفايات الصلبة والخطرة والاستفادة منها.أيضا يختص هذا البرنامج بالمجهودات التي تمنع تلوث الهواء والماء والتربة والتلوث بالضجيج وتتحكم فيها. ويطور المهندسون البيئيون المعدات لقياس مستويات التلوث، ويقومون بإجراء التجارب لتقدير تأثيرات أنواع الملوثات المختلفة. كما يطورون أيضاً التقنيات لحماية الأرض من التلوث، هذا بالإضافة إلى المعرفة بالقانون المتعلق بالهندسة البيئية، وأيضاً دراسات عن الأثر البيئي للمشاريع المقترحة.